刑事调查

事件发生后，台南市警察局立即展开侦察，在事件发生一周后公布一卷监视录像带，其中拍摄到两名嫌疑男子，但当地民众普遍反应没有看到过这个人，认为不是本地人。泛蓝人士对于当地警方的侦察表示怀疑，认为有政治力介入的可能性，因此提出由国际专家对案件进行调查，泛绿阵营对此亦表示同意。

3月29日，美籍华人李昌钰博士推荐的3名美国刑事和弹道专家抵达台湾，开始调查工作，他们取得了事件发生时的所有证物，并到现场勘察，将会把采样到的资料带回美国，与李昌钰共同讨论。民进党虽然之前表示欢迎国际刑事专家对事件展开调查，不过在3月29日当天又表示，李昌钰身为连宋北美后援会的会长，有关聘请李昌钰的事宜都是由泛蓝阵营搭线，陪同美国专家做翻译的雷倩也是新党党员，因此对李昌钰的公正性提出了质疑，但仍表示不抗拒刑事局与李昌钰一同进行分析调查。

3月30日，3名美国专家结束调查工作，在离台前的记者会上，他们表示受到台湾政府的充分配合，并且还会见了陈水扁本人，并亲自检查了他的伤口。他们认为伤口确实是枪伤无误，而且是新的伤口，但是无法作出进一步推断，因为伤口已经开始愈合。此外他们还表示基本上已经能够确定凶手是近距离还是远距离射击，但目前不能公开，因为详细的鉴定结果必须跟李昌钰博士确认后才可公布。

4月9日，李昌钰抵达台湾后，在机场表示自己只是进行鉴识工作，后续的调查还需要台湾政府部门自行负责，而且他表示事件可能成为一宗悬案。当天他首先秘密拜访总统府，检查了陈水扁和吕秀莲的伤口，确认是枪伤，而且是新的，但是就无法推测具体受伤的时间；随后他又到台北调查局领取所有证物和照片进行研究。李昌钰于下午到达台南，先访问奇美医院与医生谈话，再度确认之前受怀疑的X光片没有问题。晚间他来到案发现场，采用激光技术判断出凶手可能是躲在公共汽车牌附近射击，而且由于车内满布细微玻璃碎片，是由外向内射击所造成的无庸置疑。李昌钰还发现子弹有机器印（machine mark），这需要进一步调查；至于陈水扁的外套上并没有火药残留痕迹，代表远距离射击可能性极高。

李昌钰记者会编辑

台湾最高法院检察署及刑事警察局召开联合记者会当晚，鉴识专家李昌钰博士随即在美国康乃狄克州自宅召开记者会。他首先肯定台湾警调单位“取得重大进展及突破”。他说，时任刑事局局长侯友宜于案情发表会前日曾与他通过电话，把案情做了一次最新的汇报。依台北警方目前最新侦办进度而言，他认为三一九枪击案情可能有重大进展。

他也表示，依目前证据研判，陈义雄为凶嫌的可能性非常高。并建议：“由于陈义雄已被发现在台南安平港溺毙，溺毙的确比较难以确定是他杀或自杀，但仍可以从地点、是否有遗书、尸体外伤等查出重要线索。即使陈已火化，也可从验尸照片、法医的记录等，查出蛛丝马迹。”

李博士表示，国外也有许多嫌犯已死亡、凶器未寻获，但仍径自宣布破案的例子。他表示：“最重要的是办案人员能否达到百分之百的确信。例如三一九枪击事件，警方即是运用排除法，逐一排除不可能涉案的枪支。检警所谓的重大突破，即是指目前己排除了百分之九十，只剩百分之十待查。一旦比对到仅剩一把枪未查，即使该枪支未寻获，仍可视为重要证据。”他同时承诺，必要时将返台协助调查。

李昌钰调查报告 ^[9]编辑

8月28日晚11时，李昌钰在美国召开记者会，宣布已经完成其133页的调查报告，当晚就交给驻纽约台北经济文化办事处，立即以外交包裹形式送回台北，转交负责刑事侦查的检察总长卢仁发。记者会上，李昌钰对媒体做作出以下几点交代：

1. 李昌钰的调查小组在子弹上找到十分特殊的“工具痕”（machine mark），对侦查十分有帮助，如能找到作案时使用的枪管，就可进行比对。李昌钰称，只要找到枪支，案件就解决了大半；
2. 对陈水扁衣服的检验结果发现，夹克上大部分不是血迹，而是药用油膏；在陈水扁的衬衫上也发现大量药用油膏（事后陈说他以为是被鞭炮打到，于是叫随车警卫官张春波给他擦了面速力达姆药油）^[10]；
3. 子弹上发现蓝、白衣服纤维；
4. 歹徒所使用的枪支是特制的土制枪支，由于工具痕特性一致，所以应为同一枪管。如果是两支枪管，那会是用同一机器制成，然后切成两半；
5. 由于凶手非常专业，而却又使用火力很小的枪支，因此可以排除是政治谋杀行为。

李昌钰表示自己的报告不设政治立场，不作任何推断，也不受台湾蓝绿和美国任何一方政治势力的影响。但是他却又表示“如果仔细读（《李昌钰博士鉴识团队的调查报告》^[9]），就可以知道是什么意思”。但是蓝绿两阵营对此的解读却完全相反，各自强调对自己有利的证据来发挥，民进党称该调查报告与刑事局之前的调查报告基本相似，而李昌钰做出的“非政治谋杀”推论结论过于仓促，因为台湾与美国的情况不同，不应那么早排除任何可能。蓝营则指，“非政治谋杀”的结论证明了蓝营的清白，他们更进一步指出，既然动机非纯粹的暗杀，则唯一可能的解释就是企图影响选举结果，而这又是对当时选情并不看好的绿营有利。

2004年8月中华民国最高法院检察署公布《李昌钰博士鉴识团队的调查报告》^[9]，证物编号4的夹克右下缘有类似弹孔状之孔洞，报告认为”弹洞的形状和形态说明这个弹头有可能是以低角度，由侧面穿入夹克内“^[9]。但是调查报告公布之后，仍有一些媒体的报导说，陈总统的夹克没有破洞；据中广新闻陈弘志报导，2004年12月李昌钰返台期间，回答关于调查结果的五个鉴识上的提问，表示“不知道”^[11]：

• 子弹穿过陈总统的衬衫并划伤肚皮，夹克却没有破洞，原因“不知道”。
• 陈总统的夹克没有破洞，衬衫为何会出现六个小洞“不知道”。
• 作案枪支型号“不知道”。
• 火药用量多寡“不知道”。
• 吉普车的车速“不知道”。

李昌钰说，由于部分资料不齐，刑事警察局和部分民间单位据此所做的各项模拟试射结果，其实并不能回推当时枪击真正的情形^[11]。但到22日时，新闻又称李昌钰强调：“外界质疑总统夹克上只有一个洞，但为何在衬衫上却有6个小洞，这些其实在物理上都说得过去。”^[